Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx4Q6RUU0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx4Q6RUU0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms