Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Med16Q6PGF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms