Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2surpQ6NV83 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2surpQ6NV83 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms