Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9aQ68FE2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg9aQ68FE2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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