Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms