Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nkain3Q3URJ8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nkain3Q3URJ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nkain3Q3URJ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nkain3Q3URJ8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nkain3Q3URJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nkain3Q3URJ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nkain3Q3URJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkain3Q3URJ8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms