Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MitfQ08874 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MitfQ08874 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MitfQ08874 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms