Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psme1P97371 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme1P97371 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psme1P97371 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms