Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb41P48193 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb41P48193 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb41P48193 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms