Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TfamP40630 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TfamP40630 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TfamP40630 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TfamP40630 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TfamP40630 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TfamP40630 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TfamP40630 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TfamP40630 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms