Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kif3aP28741 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kif3aP28741 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms