Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lama1P19137 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lama1P19137 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms