Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spi1P17433 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms