Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chil3O35744 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chil3O35744 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chil3O35744 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms