Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf5O35326 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf5O35326 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms