Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms