Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms