Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Catsperg2C6KI89 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Catsperg2C6KI89 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms