Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brpf1B2RRD7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms