Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms