Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700019A02RikA0A087WPV9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms