Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six6Q9QZ28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms