Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PnckQ9QYK9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms