Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx6Q9ER75 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx6Q9ER75 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms