Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms