Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc4Q8BP86 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc4Q8BP86 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms