Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbtb40Q6PCS8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zbtb40Q6PCS8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbtb40Q6PCS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms