Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knl1Q66JQ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Knl1Q66JQ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knl1Q66JQ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms