Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mdc1Q5PSV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdc1Q5PSV9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdc1Q5PSV9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms