Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nkain3Q3URJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain3Q3URJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms