Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod2Q3UHZ5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod2Q3UHZ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms