Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim63Q38HM4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim63Q38HM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms