Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf9Q07105 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gdf9Q07105 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms