Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psme1P97371 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psme1P97371 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psme1P97371 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms