Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct3P80318 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms