Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb3P09026 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms