Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f6O54917 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2f6O54917 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms