Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad7O35253 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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