Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4aF8VPX6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4aF8VPX6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms