Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1iE9Q7P2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms