Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms