Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpv2Q9WTR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms