Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gpc1Q9QZF2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gpc1Q9QZF2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gpc1Q9QZF2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpc1Q9QZF2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gpc1Q9QZF2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gpc1Q9QZF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms