Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms