Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smco4Q9JIS3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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