Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm5Q9D806 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm5Q9D806 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms