Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsnaxip1Q99P25 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsnaxip1Q99P25 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms