Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gps1Q99LD4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms