Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lactb2Q99KR3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lactb2Q99KR3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lactb2Q99KR3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms