Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms